Высшим органом управления АО «Нефтгазтадқиқот» является Общее собрание акционеров. Наблюдательный совет, избранный Общим собранием, осуществляет общее руководство обществом, определяет приоритетные направления деятельности, перспективы развития и стратегию, а также разрабатывает ближайшие цели и тактику их достижения. Текущим управлением занимается коллегиальный исполнительный орган – Управление, которое организует и контролирует выполнение решений, принятых Общим собранием и Наблюдательным советом.
